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条形码的筛选(SW-CJ-1FD应用)

返回列表 来源:未知 发布日期:2020-09-14 13:55【

1 材料与方法


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2 结果


本试验对3个候选的 DNA 条形码片段cpn60、 recA 和ppsA 进行 PCR 扩增和琼脂 糖 凝 胶 电 泳 检 测。候 选 基 因 的 长 度 在530bp~1065bp。 其中recA 序 列 最 长,约 为1065bp;ppsA 序 列 最 短,长度约为530bp;cpn60序列长度约为555bp。 GC含量 ppsA 基 因 最 高,为 65%;其 次 是recA 和 cpn60,分别为59.1%和57.2%。序列变异位点数可 反 映 序 列 的 变 异 程 度,cpn60 变 异 位 点 数 最 多 (147);变异位点占总长度的比例也最高(27.68%), 显 著 高 于 recA(12.42%)和 ppsA(2.3%),提 示 cpn60基因可 为 物 种 提 供 更 多 的 鉴 别 信 息。此 外, cpn60基 因 的 PCR 扩增测序成功率也是 最高的 (75.8%),更容易获得。






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